Publications

2003

• Autostéréogramme d'un volcan cache
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Autostereogram with an hidden volcano (Autostéréogramme d'un volcan cache)
• Placement 'harmonieux' de 8 points sur une sphere par recuit simule
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Harmonious' arrangement of 8 points on a sphere by means of simulated annealing (Placement 'harmonieux' de 8 points sur une sphere par recuit simule)
• Placement 'harmonieux' de 8 points sur une sphere par recuit simule
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Harmonious' arrangement of 8 points on a sphere by means of simulated annealing (Placement 'harmonieux' de 8 points sur une sphere par recuit simule)
• Placement 'harmonieux' de 8 points sur une sphère par recuit simulé
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Harmonious' arrangement of 8 points on a sphere by means of simulated annealing (Placement 'harmonieux' de 8 points sur une sphère par recuit simule)
• Image decomposition. Application to SAR images.
  
  • Aujol Jean-François
  • Aubert Gilles
  • Blanc-Féraud Laure
  • Chambolle Antonin
  Lecture Notes in Computer Science, Springer, 2003, Scale Space Methods in Computer Vision (2695), pp.pages 297-312. We construct an algorithm to split an image into a sum u+v of a bounded variation component and a component containing the textures and the noise. This decomposition is inspired from a recent work of Y. Meyer. We find this decomposition by minimizing a convex functional which depends on the two variables u and v, alternatively in each variable. Each minimization is based on a projection algorithm to minimize the total variation. We carry out the mathematical study of our method. We present some numerical results. In particular, we show how the u component can be used in nontextured SAR image restoration. (10.1007/3-540-44935-3)
  DOI : 10.1007/3-540-44935-3
• Filtrage en ondelettes d'un champ fractal bidimensionnel
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Wavelet filtering of a bidimensional fractal field (Filtrage en ondelettes d'un champ fractal bidimensionnel)
• Placement 'harmonieux' de 4 points sur une sphere -un Tetraedre- par recuit simule
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Harmonious' arrangement of 4 points on a sphere -a Tetrahedron- by means of simulated annealing (Placement 'harmonieux' de 4 points sur une sphere -un Tetraedre- par recuit simule)
• Placement 'harmonieux' de 12 points sur une sphere -un Icosaedre- par recuit simule
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Harmonious' arrangement of 12 points on a sphere -an Icosahedron- by means of simulated annealing (Placement 'harmonieux' de 12 points sur une sphere -un Icosaedre- par recuit simule)
• Placement 'harmonieux' de 6 points sur une sphère -un Octaedre- par recuit simulé
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Harmonious' arrangement of 6 points on a sphere -an Octahedron- by means of simulated annealing (Placement 'harmonieux' de 6 points sur une sphère -un Octaedre- par recuit simulé)
• Placement 'harmonieux' de 24 points sur une sphère par recuit simulé
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Harmonious' arrangement of 24 points on a sphere by means of simulated annealing (Placement 'harmonieux' de 24 points sur une sphère par recuit simulé)
• Placement 'harmonieux' de 12 points sur une sphère -un Icosaedre- par recuit simulé
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Harmonious' arrangement of 12 points on a sphere -an Icosahedron- by means of simulated annealing (Placement 'harmonieux' de 12 points sur une sphère -un Icosaedre- par recuit simulé)
• Placement 'harmonieux' de 6 points sur une sphere -un Octaedre- par recuit simule
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Harmonious' arrangement of 6 points on a sphere -an Octahedron- by means of simulated annealing (Placement 'harmonieux' de 6 points sur une sphere -un Octaedre- par recuit simule)
• Placement 'harmonieux' de 24 points sur une sphère par recuit simulé
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Harmonious' arrangement of 24 points on a sphere by means of simulated annealing (Placement 'harmonieux' de 24 points sur une sphère par recuit simulé)
• Placement 'harmonieux' de 4 points sur une sphère -un Tetraedre- par recuit simulé
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Harmonious' arrangement of 4 points on a sphere -a Tetrahedron- by means of simulated annealing (Placement 'harmonieux' de 4 points sur une sphère -un Tetraedre- par recuit simulé)
• Zoom sur une représentation tridimensionnelle de l'ensemble de Mandelbrot
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Tridimensional zoom in on the Mandelbrot set (Zoom sur une représentation tridimensionnelle de l'ensemble de Mandelbrot)
• Zoom sur une représentation tridimensionnelle de l'ensemble de Mandelbrot
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Tridimensional zoom in on the Mandelbrot set (Zoom sur une représentation tridimensionnelle de l'ensemble de Mandelbrot)
• A genome-wide scan in families with maturity-onset diabetes of the young: evidence for further genetic heterogeneity.
  
  • Frayling Timothy M
  • Lindgren Cecilia M
  • Chevre Jean Claude
  • Menzel Stephan
  • Wishart Marie
  • Benmezroua Yamina
  • Brown Alison
  • Evans Julie C
  • Rao Pamidghantam Subba
  • Dina Christian
  • Lecoeur Cécile
  • Kanninen Timo
  • Almgren Peter
  • Bulman Michael P
  • Wang Youxiang
  • Mills James
  • Wright-Pascoe Rosemarie
  • Mahtani Melanie M
  • Prisco Francesco
  • Costa Angels
  • Cognet Ignacio
  • Hansen Torben
  • Pedersen Oluf
  • Ellard Sian
  • Tuomi Tiinamaija
  • Groop Leif C
  • Froguel Philippe
  • Hattersley Andrew T
  • Vaxillaire Martine
  Diabetes, American Diabetes Association, 2003, 52 (3), pp.872-81. Maturity-onset diabetes of the young (MODY) is a heterogeneous single gene disorder characterized by non-insulin-dependent diabetes, an early onset and autosomal dominant inheritance. Mutations in six genes have been shown to cause MODY. Approximately 15-20% of families fitting MODY criteria do not have mutations in any of the known genes. These families provide a rich resource for the identification of new MODY genes. This will potentially enable further dissection of clinical heterogeneity and bring new insights into mechanisms of beta-cell dysfunction. To facilitate the identification of novel MODY loci, we combined the results from three genome-wide scans on a total of 23 families fitting MODY criteria. We used both a strict parametric model of inheritance with heterogeneity and a model-free analysis. We did not identify any single novel locus but provided putative evidence for linkage to chromosomes 6 (nonparametric linkage [NPL]score 2.12 at 71 cM) and 10 (NPL score 1.88 at 169-175 cM), and to chromosomes 3 (heterogeneity LOD [HLOD] score 1.27 at 124 cM) and 5 (HLOD score 1.22 at 175 cM) in 14 more strictly defined families. Our results provide evidence for further heterogeneity in MODY. (10.2337/diabetes.52.3.872)
  DOI : 10.2337/diabetes.52.3.872
• Visualisation tridimensionnelle de l'évolution d'un automate cellulaire binaire bidimensionnel élémentaire avec 1 point central de départ blanc
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. Tridimensional display of the evolution of a bidimensional binary cellular automaton with 1 white starting central point (Visualisation tridimensionnelle de l'evolution d'un automate cellulaire binaire bidimensionnel elementaire avec 1 point central de depart blanc)
• 64 automates cellulaires binaires bidimensionnels élémentaires avec 1 point central de départ blanc
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. 64 elementary bidimensional binary cellular automata with 1 white starting central point (64 automates cellulaires binaires bidimensionnels elementaires avec 1 point central de depart blanc)
• 256 automates cellulaires binaires monodimensionnels élémentaires avec 1 point de départ blanc (l'automate numéro 0 est en bas et a gauche alors que le numéro 255 est en haut et a droite)
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. 256 elementary monodimensional binary cellular automata with 1 white starting point (bottom left is the automata number 0 when top right is the number 255) (256 automates cellulaires binaires monodimensionnels elementaires avec 1 point de depart blanc (l'automate numéro 0 est en bas et a gauche alors que le numéro 255 est en haut et a droite))
• Un automate cellulaire binaire monodimensionnel elementaire -90- avec 49 points de depart blancs -sur la ligne du bas
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. An elementary monodimensional binary cellular automaton -90- with 49 white starting points -on the bottom line- (Un automate cellulaire binaire monodimensionnel elementaire -90- avec 49 points de depart blancs -sur la ligne du bas-)
• Un automate cellulaire binaire monodimensionnel élémentaire -90- avec 1 point de départ blanc -en bas et au milieu
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. An elementary monodimensional binary cellular automaton -90- with 1 white starting point -bottom middle- (Un automate cellulaire binaire monodimensionnel élémentaire -90- avec 1 point de départ blanc -en bas et au milieu-)
• Un automate cellulaire binaire monodimensionnel elementaire -90- avec 1 point de depart blanc -en bas et au milieu
  
  • Colonna Jean-François
  , 2003. An elementary monodimensional binary cellular automaton -90- with 1 white starting point -bottom middle- (Un automate cellulaire binaire monodimensionnel elementaire -90- avec 1 point de depart blanc -en bas et au milieu-)
• Reductive genome evolution in Buchnera aphidicola
  
  • van Ham Roeland
  • Kamerbeek Judith
  • Palacios Carmen
  • Rausell Carolina
  • Abascal Federico
  • Bastolla Ugo
  • Fernández Jose
  • Jiménez Luis
  • Postigo Marina
  • Silva Francisco
  • Tamames Javier
  • Viguera Enrique
  • Latorre Amparo
  • Valencia Alfonso
  • Morán Federico
  • Moya Andrés
  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, National Academy of Sciences, 2003, 100 (2), pp.581-586. We have sequenced the genome of the intracellular symbiont Buchnera aphidicola from the aphid Baizongia pistacea . This strain diverged 80–150 million years ago from the common ancestor of two previously sequenced Buchnera strains. Here, a field-collected, nonclonal sample of insects was used as source material for laboratory procedures. As a consequence, the genome assembly unveiled intrapopulational variation, consisting of ≈1,200 polymorphic sites. Comparison of the 618-kb (kbp) genome with the two other Buchnera genomes revealed a nearly perfect gene-order conservation, indicating that the onset of genomic stasis coincided closely with establishment of the symbiosis with aphids, ≈200 million years ago. Extensive genome reduction also predates the synchronous diversification of Buchnera and its host; but, at a slower rate, gene loss continues among the extant lineages. A computational study of protein folding predicts that proteins in Buchnera , as well as proteins of other intracellular bacteria, are generally characterized by smaller folding efficiency compared with proteins of free living bacteria. These and other degenerative genomic features are discussed in light of compensatory processes and theoretical predictions on the long-term evolutionary fate of symbionts like Buchnera . (10.1073/pnas.0235981100)
  DOI : 10.1073/pnas.0235981100
• Estimating deformations of stationary processes
  
  • Clerc Maureen
  • Mallat Stéphane
  Annals of Statistics, Institute of Mathematical Statistics, 2003, 31 (6), pp.pp. 1772-1821. This paper studies classes of nonstationary processes, such as warped processes and frequency-modulated processes, that result from the deformation of stationary processes. Estimating deformations can often provide important information about an underlying physical phenomenon. A computational harmonic analysis viewpoint shows that the deformed autocovariance satisfies a transport equation at small scales, with a velocity proportional to a deformation gradient. We derive an estimator of the deformation from a single realization of the deformed process, with a proof of consistency under appropriate assumptions. (10.1214/aos/1074290327)
  DOI : 10.1214/aos/1074290327